Normalmente es por si tienes apache funcionando como modulo PHP pero no debería tener problema nadie. Una vez tengas la forma que te funciona, hazlo todas las veces de la misma forma en futuras actualizaciones via SSH.
1ª opción. Hay que entrar en el ssh, entrar en la carpeta de magento y luego ejecutar los siguientes comandos:
rm -rf downloader/pearlib/cache/ downloader/pearlib/download/* ./pear upgrade-all rm -rf downloader/pearlib/cache/ downloader/pearlib/download/*
2ª opción. Si se recibe un mensaje que dice nothing to update, probar con esto:
./pear mage-setup . ./pear install -f magento-core/Mage_All_Latest-stable rm -rf downloader/pearlib/cache/* downloader/pearlib/download/*
Con una de estas dos soluciones deberia funcionar, UNA. Como sugerencia diré que hay que probar la primera y en caso de que no vaya la segunda.
